Do té doby tradiční zelenobílá vlajka nebyla z heraldického hlediska správná, a tak ji bylo třeba změnit. Nový návrh vychází z barev platného historického městského znaku, jehož poslední podoba je dána znakovým privilegiem Jana Kristiána z Eggenbergu, které vydal 15. dubna 1671. Definitivní podobu dostala městská vlajka po drobné úpravě aby nebyla zaměnitelná s podobnou vlajkou města Hodonín.
Nový prapor tvoří 3 vodorovné pruhy v poměru 1 : 4 : 1. Uprostřed bílého pruhu je červená růže se žlutým semeníkem a zelenými kališními lístky. Poměr šířky a délky praporu je 2 : 3. Velikost středové růže není stanovena přesně, ale podvýbor pro heraldiku a vexilologii doporučuje používat růži o průměru jedné poloviny nebo dvou třetin šířky vlajky.
Poprvé byl nový prapor k vidění během Slavností pětilisté růže a od té doby je vyvěšen na Českokrumlovské radnici při všech významných příležitostech.
V úterý 14. srpna 2001 oficiálně předal předseda Poslanecké sněmovny Parlamentu Václav Klaus dekret o používání praporu Města Český Krumlov do rukou místostarosty Miloše Michálka. Předání proběhlo v Poslanecké sněmovně v místnosti "Státní akty". Od tohoto dne tedy může každý vyvěsit novou českokrumlovskou vlajku. Pro vyvěšování vlajky neplatí žádná přímá omezení.
Kdo si chce nechat vlajku zhotovit, může kontaktovat autorizovaného výrobce :
LIBEA s.r.o.
Za cukrarnou 534
463 11 Liberec
E-mail : info@libea.cz
Na rozdíl od vlajky stále platí omezení pro užívání českokrumlovského znaku.
O použití znaku je třeba nadále žádat radu Města Český Krumlov.
Další informace :
Významné návštěvy města a zámku Český Krumlov v letošním roce
Významné aktivity města Český Krumlov
Významné kulturní akce v roce 2002 ve městě Český Krumlov
Významné kulturní akce v roce 2003 ve městě Český Krumlov
Správa města Český Krumlov
Základní charakteristika města Český Krumlov